To je pravda, překlad do češtiny je místy opravdu šílený. Dost to pomáhá té matoucnosti. Ale např. cenotvorba rozhodně ve VM není intuitivní. Přidávání vlastních polí také není uživatelsky úplně zvládnuto. No a naopak multivendor shop je věc kterou opravdu využije snad to jedno procento.

Bootstrap (pokud obecně akceptujeme CSS framework jako dobrý nápad) je samozřejmě lepší v novější verzi, ale použití verze, kterou nepodporuje Joomla v jádru, může ve finále přinést pro méně zkušené uživatele víc škody než užitku. Přirovnal bych to ke všem těm modulům a pluginům pro Joomla 2.5 nahrávajících si různé jQuery. To bylo konfliktů a nefunkčních stránek

Řešením by mohl být ten systémový plugin, nebo možná jednodušeji javascript, který třídy přejmenuje, jak píše H13, ale některé věci mění Bootstrap 3 dost zásadně, a to je např. Box sizing model, který nastavuje standardně na border-box, což značně znepříjemní např. nasazení Phoca Cart do již hotové šablony.

VM teoreticky nějaký mód více prodejců podporuje, nikdy jsem ale nezkoušel jej uvést do provozu, zkuste si projít dokumentaci, i když se obávám že pro VM jí moc nebude.
Pro HikaShop existuje komerční rozšíření HikaMarket Multi Vendor, přímo od tvůrců HikaSho, které by toto mělo také podporovat.
Osobně bych spíše raději volil ten HikaShop, pokud teprve začínáte a nemáte ještě VM rozběhaný, čekal bych tam dotaženější funkčnost i dokumentaci.